http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10570195
Yersinia pestis, the cause of plague, is a recently emerged clone of Yersinia pseudotuberculosis.
Achtman M, Zurth K, Morelli G, Torrea G, Guiyoule A, Carniel E.
Plague, one of the most devastating diseases of human history, is caused by Yersinia pestis. In this study, we analyzed the population genetic structure of Y. pestis and the two other pathogenic Yersinia species, Y. pseudotuberculosis and Y. enterocolitica. Fragments of five housekeeping genes and a gene involved in the synthesis of lipopolysaccharide were sequenced from 36 strains representing the global diversity of Y. pestis and from 12-13 strains from each of the other species. No sequence diversity was found in any Y. pestis gene, and these alleles were identical or nearly identical to alleles from Y. pseudotuberculosis. Thus, Y. pestis is a clone that evolved from Y. pseudotuberculosis 1,500-20,000 years ago, shortly before the first known pandemics of human plague. (Proc Natl Acad Sci U S A. 1999 Nov 23;96(24):14043-8)
Чума произошла примерно 20 тысяч лет назад от не очень болезнетворного микроорганизма Yersinia pseudotuberculosus. Нашли мутировавшие гены.
Полный текст
http://www.pnas.org/content/96/24/14043.full.pdf
Там выделили три морфы этой чумы, пути их распространения - разные были... Но главное - что это в самом деле недавняя болезнь. Поскольку возраст человечества современного типа под 200 тысяч лет, это вообще только что. В исторический период. Почти вместе с письменностью.
Есть раздел про микроэволюцию этой самой Йерсинии пестис.
Если это не опровергли - очень интересно.