February 24th, 2010

geo

Интронная катастрофа и минимальный геном

http://ivanov-petrov.livejournal.com/1388189.html?thread=67731357#t67731357

Моей была только не очень умелая подача, а дальше комментаторы сами выкручивались и вышли на очень интересную тему. То есть вышел в основном прахвессор, остальные задают ему вопросы разной удачности

prahvessor
Пример очень адаптивного механизма: сплайсинг и, как следствие, альтернативный сплайсинг. При том что первоначально, похоже, возник как ответ на интронную катастрофу после получения интронов из митохондрий (про это есть красивая статья Кунина).
Потом из нужды сделали добродетель: раз уж сплайсируем гены, то почему бы не по-разному. В результат оказалось возможным, например, иметь изоформы, частично полностью идентичные, а частично совсем разные (хрестоматийный пример - секретируемый иммуноглобулин и мембранная форма, работающая рецептором: антиген0-связывающий домен один и тот же). Дупликациями такого не сделать.
Впрочем, дрожжи (сахаромицеты), похоже. сплаййсинг практически потеряли, а сейчас воссоздают (механизм не совсем тот и не видно старых интронов).
Аналогично: комбинаторный иммунитет (с механизмом, похоже, транспозонного происхождения, см. статьи Капитонова и Панчина).

уже ближе к теме: концепция "минимального генома" - т.е. минимального набора генов, при котором можно жить независимо. Сначала сделали теорерически, сравнением геномов, как набор генов, общих для всех живых существ (Кунин-Мушегян, потом много кто), причемсразу вылезла куча поучительных осложнений (неродственные белки с одинаковой функцией и т.п.). Потом делали выбивая гены по одному, и глядя, что получится (тоже, на самом деле, не вполне тривиально - во-первых, зависит от того, как делать, в хороших условиях или при соревновании, во-вторых, бывают синтетические летали - по отдельности вышибать можно, вместе - нет). Тем не менее, какая-то картинка получилась.

А теперь Крег Вентер хочет реально сделать микоплазму с минимальным геномом. И сделает.
Collapse )
geo

Подземный город

irin_v дала ссылку http://www.youtube.com/watch?v=CkWLF6477tU
Это об огромной колонии муравьев, опыты Холлдоблера, человека знаменитого http://en.wikipedia.org/wiki/Bert_H%C3%B6lldobler. Изучение воздухообмена. Залили 10 т отвердителя и потом раскопали - слепок подземного устройства

PS Все комменты - как же муравьишек залили. Отвечаю. Отдельный вопрос - хорошо это или плохо. Решайте. Но: это не свойство данного ученого. Так устроена биология. В кадре - обыденная работа, так регулярно самые разные ученые изучают подземное устройство муравейников и термитников. А что нейробиологи регулярно с кошками и мышками делают -.
Биология не гуманна. Я бы просил выкинуть дурь из головы. В лучших проявлениях она "естественнонаучна" - точна, критична, операциональна, прогностична. Но никакой особенной чувствительности в ней нет. Нет и жестокости. Специально мучить не будут. Но если убить легче и дешевле - убьют. Не стоит питать иллюзий - это входит в дух современной науки, она вся такая. И психология тоже.

PPS. Подумал и приписал парадокс: "И филология тоже".